La Bourgogne-Franche-Comté veut retrouver sa souveraineté dans le secteur de la santé et être le premier pays européen innovant dans ce domaine. Selon Franck Robine, préfet de la région, la biotechnologie et la biothérapie sont les deux secteurs clés sur lesquels la région veut capitaliser pour rester innovante. Avec 50 sociétés de santé spécialisées dans la biothérapie, la région possède déjà une bonne base. L’excellence de la recherche et de la formation universitaire est un autre atout de la région. La Bourgogne-Franche-Comté doit toutefois faire connaître ses atouts au niveau international et envisager des partenariats interrégionaux dans le domaine de la biothérapie et de la bioproduction. Les résultats des Investissements Directs Étrangers montrent que la région est attractive pour les partenaires transfrontaliers, mais il reste du chemin à parcourir pour faire connaître les atouts de la région.